Entendendo a expressão:

^(?!.*exemplo).+$

• ^: Correspondência no início da linha.
• (?!.*exemplo): Verificação negativa de que a linha contém o texto especificado. O ?! significa "não seguido por".
• .+: Correspondência de um ou mais caracteres em qualquer posição da linha.
• $: Correspondência no final da linha.

Removendo o texto

1. Abra o arquivo no Notepad++.
2. Pressione Ctrl + F para abrir a janela "Localizar".
3. Selecione a guia "Search Mode > Regular expression".
4. No campo "Find What", insira a expressão regular, substituindo "exemplo" pelo texto que você deseja excluir. 
5. No campo "Replace with", deixe o valor vazio.

^(?!.*exemplo).+$